agarosegel er den vanligste metoden for å visualisere DNA . Forskjellige prosenter av agarose kan brukes avhengig av størrelsen av DNA som skal visualiseres . En lav prosentandel av agarose, slik som 0,7 prosent , har oppløsningen for å visualisere store DNA -fragmenter. En høyere prosentandel, slik som 2 prosent , blir ofte brukt til å visualisere små fragmenter av DNA. For å visualisere DNA , er etidiumbromid ofte brukt som det intercalates med DNA og fluoresces i UV-lys .
Polyakrylamidgeler arkiv
Polyakrylamidgeler brukes til å skille DNA-fragmenter så små som 10 basepar opp til 1 kb . Disse geler har en liten skilleområde, men med høy oppløsning. Men de er også mer komplisert å tilberede . Det er også mulig å laste store mengder DNA uten å påvirke oppløsning. Som med agarose , er etidiumbromid ofte brukt for å visualisere DNA-fragmentene , men polyakrylamid kan slukke fluorescens , noe som gjør det vanskelig å visualisere små mengder DNA .
Pulse -Field
Denne formen for elektroforese brukes til å separere store DNA-molekyler og er ofte brukt for genotyping . Store DNA-fragmenter vandrer med en lignende hastighet . Det kan være vanskelig , og derfor å løse forskjellige band . Puls -field elektroforese veksler det elektriske felt . Dette gir større separasjon og oppløsning av DNA .
Kapil
kapil elektroforese er en rask og følsom metode for å separere DNA . Små mengder av DNA kan løses . DNA kan visualiseres med fluorescerende merking eller ved hjelp av UV- lys .
Denaturing
separasjon av DNA kan kompliseres av sin struktur . Det er mulig ved hjelp av urea og formamid for å ødelegge strukturen ved å senke smeltepunktet for DNA. Dette kan brukes i både agarose -og polyakrylamid-geler .
Betraktninger
elektroforese -metoden velges vil avhenge av størrelsen av DNA-fragmentene som skal separeres . Hvordan DNA vil bli brukt etter separasjon vil også avgjøre den endelige metoden .