Bruken av et mikroskop kan brukes til å oppdage unormale celler og for å se på tilstedeværelsen av ulike celletyper . For eksempel, i sigd-celle anemi, blodceller ikke er runde , men har en sigdform. Den sigdformblir godt synlig under et mikroskop. Mikroskoper er også brukt til å oppdage urinveisinfeksjoner. Urinprøver kan undersøkes i mikroskop for å se om et stort antall bakterier er til stede .