Mekanisk fordøyelse i magen oppnås gjennom muskelsammentrekninger i mageveggen. Disse sammentrekningene kjerner maten, bryter den ned i mindre biter og blander den med magesaft.
Kemisk fordøyelse i magen oppnås ved virkningen av saltsyre og pepsin. Saltsyre skaper et surt miljø i magen som bidrar til å bryte ned maten. Pepsin er et enzym som bryter ned proteiner.
Magen gir et svært surt miljø som denaturerer proteiner og lar pepsin starte prosessen med proteinfordøyelse.