For eksempel kan en mutasjon i et gen som koder for et protein som er involvert i celledeling føre til endringer i størrelsen eller formen på organismen. En mutasjon i et gen som koder for et protein som er involvert i immunsystemet kan gjøre organismen mer mottakelig for infeksjon. En mutasjon i et gen som koder for et protein som er involvert i metabolismen kan føre til endringer i organismens vekt eller energinivå.
Mutasjoner kan også ha mer subtile effekter, som å endre fargen på organismens øyne eller hår. I noen tilfeller kan mutasjoner til og med være fordelaktige, for eksempel når de gir resistens mot en sykdom.
Effektene av mutasjoner på egenskaper kan være komplekse og uforutsigbare, og de kan variere avhengig av organismen og det spesifikke genet som er mutert.