Sekvensielle Chip Protokoller

Sekvensiell kromatin immunoprecipitation , kjent som SeqChIP , er en biologisk test ment å definere på hvilke måter to proteiner samhandler innenfor en region i en deoksyribonukleinsyre ( DNA ) tråden. Forskere engasjere et bestemt sett av bestilte oppgaver å avsløre tre mulige sammenhenger mellom proteiner som skal utredes . Som med de fleste science tester , det vesener med rengjøring og ender med konklusjonen . Ifølge Harvard forskere , kan teknologiske fremskritt i SeqChIP analyse tillate forskere å bredere studere biologiske fenomener . Forbered

SeqChIP eksperimenter inneholde grundige forberedelser for å desinfisere og rengjøre de magnetiske perler for eksperimentet . Forskere må vaske perlene flere ganger og rengjør dem i " blokk" løsning . Perlene ble deretter suspendert til tørking og re- vasket. Vanligvis forskere gå en dag før den endelige vaske før du går videre til linking scenen . Gitt natur varierende DNA-strengene for vurdering, denne fasen av forberedelsene varierer også i kompleksitet . Men fortsatt en vitenskapelig sannhet : renere testen , renere resultatet
fornettning arkiv

Forskere velger DNA protein komplekser , eller områder i tråd , for ekstrautstyr. med et antistoff . I effekt , biologer sidestille proteiner for å observere deres interaksjon . Når observert , må kryss -link for å bli bekreftet i omvendt rekkefølge . Har proteiner fortsatt forholde når sekvensen er reversert ? SeqChIP forskere mener at sameksistens av både proteiner når vurderes i motsatt retning gi overbevisende bevis for fullført co - belegg , og tillate entydig differensiering av delvis belegg og ingen co - belegg .

Purify

Polymerase Chain Reaction , eller " PCR ", er en DNA - forsterkning prosess som sjekker kvaliteten , eller renhet , av DNA . PCR er gjennomført i tre etapper . Først smelter PCR trådene fra hverandre ved å heve temperaturen . Så , forskere bringe de to mal tråder tilbake sammen med PCR primere . Til slutt , biologer ruge DNA slik at polymerase primere forårsake celler under behandling å klynge . Derfra forskere flytter til undersøkelse av klyngene .
Vurdere

analyse undersøker DNA-trådene for tilstedeværelse eller fravær av " belegg ", et interaktivt forhold mellom proteiner. To proteiner som alltid forbinder med den samme DNA-fragment som har fullstendig ko- belegg , ingen co- belegg oppstår når proteinene kan bare forbindes gjennom gjensidig eksklusive sub-populasjoner av DNA-tråden , en anordning delvis ko- belegg som enkelte DNA- molekyler som har både proteiner , mens andre har den ene eller den andre. Hvis SeqChIP testing er en prosedyre i tråd med biologi , gir det forskere med muligheten til å søke enkeltresultatene til en hel genomisk struktur .