Den eksakte årsaken til unormaliteten i beinremodellering er ukjent, men det antas å være relatert til en kombinasjon av genetiske og miljømessige faktorer. Noen mennesker kan ha en genetisk disposisjon for å utvikle sykdommen, mens visse miljøfaktorer, som virusinfeksjoner, også kan spille en rolle i å utløse den.
Forskere har identifisert flere genetiske mutasjoner som ofte er assosiert med Pagets sykdom. Disse mutasjonene påvirker gener som er involvert i reguleringen av beincellefunksjon og benmetabolisme. Det er imidlertid viktig å merke seg at disse mutasjonene alene ikke avgjør om en person vil utvikle Pagets sykdom. Andre faktorer, som miljømessige triggere, kan også være nødvendige for at sykdommen skal manifestere seg.
Oppsummert er årsaken til Pagets bensykdom kompleks og involverer både genetiske og miljømessige faktorer. Mens genetiske mutasjoner kan øke risikoen for å utvikle sykdommen, antas andre faktorer også å spille en rolle i utviklingen og progresjonen.