Skjoldbruskkjertelektomi, total fjerning av skjoldbruskkjertelen, utføres vanligvis for avansert kreft i skjoldbruskkjertelen, tilbakevendende struma (en skjoldbruskkjertelforstørrelse som vedvarer etter delvis fjerning), eller når begge skjoldbruskkjertellappene er involvert i forskjellige tilstander.
Kirurger velger å bevare en del av skjoldbruskkjertelen når det er mulig, siden det hjelper til med å opprettholde normal produksjon av skjoldbruskkjertelen, og dermed reduserer muligheten for å kreve livslang hormonbehandling.