Mens UPEC er den vanligste årsaken til UVI, kan andre E. coli-stammer som mangler disse spesifikke virulensfaktorene også av og til forårsake UVI. Disse ikke-uropatogene E. coli-stammene kan forårsake UVI hos personer med svekket immunsystem eller underliggende tilstander som endrer det normale urinveisforsvaret.
Derfor kan ikke alle E. coli-stammer som forårsaker UVI klassifiseres som uropatogene. Bare de stammene som har spesifikke virulensfaktorer og er i stand til å forårsake UVI hos ellers friske individer, anses som uropatogen E. coli.