Det er ikke noe definitivt svar på dette komplekse spørsmålet, da den relative effektiviteten til alternativ og allopatisk medisin kan variere avhengig av individet, tilstanden som behandles og en rekke andre faktorer. Imidlertid er det generelt akseptert at allopatisk medisin er mer effektiv for å behandle akutte tilstander, som infeksjoner, skader og operasjoner. For kroniske tilstander kan alternativ medisin tilby en mer helhetlig tilnærming som kan adressere den underliggende roten til problemet og fremme generell velvære. I tillegg kan noen alternative terapier gi fordeler som ikke sees med allopatisk medisin, for eksempel forbedret avslapning og stressreduksjon. Til syvende og sist kan den beste tilnærmingen til behandling innebære en kombinasjon av allopatiske og alternative terapier.
