Det nevromuskulære krysset er stedet hvor nerveceller kommuniserer med muskler. Den består av det motoriske nevronet, den synaptiske kløften og muskelfiberen. Botulinumtoksinforgiftning påvirker den presynaptiske membranen til det motoriske nevronet, som er ansvarlig for å frigjøre acetylkolin, en nevrotransmitter som utløser muskelkontraksjon. Botulinumtoksin blokkerer frigjøringen av acetylkolin, forårsaker muskelsvakhet og lammelse.