Det primære komplekset er den første infeksjonen med Mycobacterium tuberculosis. Det forekommer vanligvis i lungene, men kan også forekomme i andre organer. Det primære komplekset forårsaker vanligvis ingen symptomer, eller bare milde symptomer som tretthet, vekttap og feber. Hoste, hvis tilstede, er vanligvis mild og forekommer i omtrent 50 % av tilfellene.