* Den prefrontale cortex: Dette området av hjernen er ansvarlig for kognitive funksjoner av høyere orden, som planlegging, beslutningstaking og sosial interaksjon. Personer med autisme har ofte problemer med disse funksjonene.
* Amygdala: Dette området av hjernen er involvert i å behandle følelser. Personer med autisme har ofte problemer med å gjenkjenne og forstå følelser hos seg selv og andre.
* Hippocampus: Dette området av hjernen er involvert i hukommelse og læring. Personer med autisme har ofte problemer med disse funksjonene.
* Crebellum: Dette området av hjernen er involvert i motorisk koordinering. Personer med autisme har ofte problemer med motoriske ferdigheter.
Det er viktig å merke seg at autisme ikke er forårsaket av en enkelt abnormitet i hjernen. Snarere antas det å være forårsaket av en kombinasjon av genetiske og miljømessige faktorer som påvirker måten hjernen utvikler seg og fungerer på.