Enzymet som fullfører fordøyelsen av proteiner er peptidase. Peptidaser er en klasse enzymer som bryter ned proteiner til mindre peptider og til slutt til individuelle aminosyrer. De virker ved å hydrolysere peptidbindingene som binder aminosyrer sammen i proteinkjeden. Peptidaser finnes i fordøyelsessystemet til dyr og planter og er også involvert i en rekke andre biologiske prosesser, som blodpropp og immunrespons.
