Den viktigste delen av fordøyelsessystemet er tynntarmen. Tynntarmen er et langt, kveilet rør som går fra magesekken til tykktarmen. Det er der det meste av fordøyelsen og opptaket av næringsstoffer finner sted. Tynntarmen er foret med bittesmå villi, som er fingerlignende fremspring som bidrar til å øke overflaten for absorpsjon. Tynntarmen skiller også ut enzymer som bryter ned karbohydrater, proteiner og fett til mindre molekyler som kan absorberes. Tynntarmen er også ansvarlig for absorpsjon av vann og elektrolytter.
