I tillegg kan melkesyre også føre til at kroppen produserer flere hydrogenioner, noe som kan føre til en nedgang i pH i musklene. Dette kan ytterligere redusere muskelytelsen og forårsake muskelsmerter.
Melkesyre er også et problem når den samler seg i blodet. Dette kan forårsake acidose, som er en tilstand der blodet blir for surt. Acidose kan føre til en rekke helseproblemer, inkludert kvalme, oppkast og svimmelhet. I alvorlige tilfeller kan acidose være dødelig.