KOLS påvirker først og fremst luftveiene. Det forårsaker betennelse og skade på luftveiene og lungene, noe som fører til luftstrømbegrensning. Luftveiene blir smalere, og luftsekkene (alveolene) blir skadet, noe som gjør det vanskeligere å puste. Dette kan forårsake kortpustethet, hvesing, hoste og tetthet i brystet.
Kardiovaskulært system
KOLS kan også påvirke det kardiovaskulære systemet. Den økte innsatsen som kreves for å puste kan belaste hjertet, og føre til høyt blodtrykk (hypertensjon) og økt risiko for hjertesykdom, hjertesvikt og hjerneslag.
Immunsystem
Kronisk obstruktiv lungesykdom kan svekke immunforsvaret, noe som gjør folk mer utsatt for infeksjoner som lungebetennelse og influensa. Dette er fordi KOLS skader cellene i lungene som hjelper til med å bekjempe infeksjoner.
Muskuloskeletalsystemet
KOLS kan gi endringer i muskel- og skjelettsystemet. Musklene som brukes til å puste kan bli svakere, og brystmusklene kan forstørres som svar på den økte innsatsen som kreves for å puste. Dette kan føre til smerte og ubehag.
Andre systemer
KOLS kan også påvirke andre kroppssystemer, som fordøyelsessystemet, noe som fører til gastroøsofageal refluks (GERD) og underernæring, og psykologisk velvære, forårsaker angst, depresjon og redusert livskvalitet.