Det primære molekylet som fjernes av lungene er karbondioksid (CO2). Karbondioksid er et avfallsprodukt fra cellulær respirasjon og transporteres fra vevet til lungene via blodet. En gang i lungene pustes CO2 ut i atmosfæren under pusteprosessen. Lungene spiller en avgjørende rolle for å regulere nivåene av karbondioksid i blodet, opprettholde kroppens syre-base-balanse og sikre riktig funksjon av ulike fysiologiske systemer.
