Det første trinnet i endokondral ossifikasjon er dannelsen av en bruskmodell av beinet. Denne modellen blir deretter invadert av blodårer, som bringer inn osteoblaster, celler som bygger nytt bein. Osteoblastene legger ned nytt bein på overflaten av brusken, mens bruskcellene i midten av beinmodellen dør. Etter hvert som mer og mer bein legges ned, erstattes bruskmodellen gradvis med bein.
Prosessen med endokondral ossifikasjon er avgjørende for utviklingen av skjelettet. Det lar bein vokse i lengde og bredde, og det gir dem styrken de trenger for å støtte kroppen.