Når B-lymfocytter forblir i fordøyelseskanalen, kan de differensiere seg til plasmaceller, som produserer antistoffer. Disse antistoffene kan binde seg til antigener i fordøyelseskanalen, slik som de som finnes på bakterier eller matpartikler. Denne bindingen kan føre til aktivering av immunsystemet, noe som resulterer i betennelse og skade på fordøyelseskanalen. Denne tilstanden er kjent som inflammatorisk tarmsykdom (IBD).
