Prosessen som frigjør fordøyelsesenzymer kalles sekresjon. Sekresjon er prosessen der celler frigjør stoffer, som enzymer, hormoner eller andre molekyler, til det ekstracellulære miljøet. I forbindelse med fordøyelsen skilles fordøyelsesenzymer ut av celler i fordøyelseskanalen, som spyttkjertlene, magen, bukspyttkjertelen og tynntarmen. Disse enzymene hjelper til med å bryte ned maten til mindre molekyler som kan absorberes av kroppen.