Laktoseintoleranse varierer i den japanske befolkningen. Rundt 20-30 % av japanske individer kan ha en viss grad av laktoseintoleranse, selv om ikke alle kan oppleve symptomer. Prevalensen er generelt lavere enn i noen vestlige populasjoner, hvor den kan være så høy som 75 %. Genetiske variasjoner, forskjeller i lokal mat og tilpasning til et lavere inntak av meieriprodukter gjennom årene kan alle spille en rolle i denne variasjonen.