Muskelrøret i fordøyelsessystemet kalles fordøyelseskanalen. Det starter ved munnen og slutter ved anus. Det er gjennom fordøyelseskanalen at maten inntas, fordøyes, absorberes og avfallsproduktene fra fordøyelsen elimineres. Fordøyelseskanalen består av munn, svelg, spiserør, mage, tynntarm, tykktarm, endetarm og anus. Munnen er der maten inntas og tygges, svelget er passasjen fra munnen til spiserøret, spiserøret er røret som frakter mat fra svelget til magen, magesekken er der maten brytes ned av syrer og enzymer, tynntarmen er der mesteparten av fordøyelsen og absorpsjonen av næringsstoffer skjer, tykktarmen er der vann og elektrolytter absorberes og avfallsstoffene fra fordøyelsen dannes, endetarmen er den siste delen av tykktarmen og anus er der avfallsstoffene drives ut.