Kwashiorkor oppstår ofte når et barn blir avvent fra morsmelk og introdusert til en diett med lite protein. Den viktigste årsaken er mangel på høykvalitets proteinkilder som kjøtt, fjærfe, fisk, egg og melk.
Det er viktig å merke seg at selv om proteinmangel er den primære årsaken, kan faktorer som infeksjoner og dårlige sanitærforhold forverre tilstanden.