En annen svakhet ved epidemiologiske studier er at det er vanskelig å kontrollere for alle potensielle skjevheter. Bias kan oppstå når studiedesignet eller datainnsamlingsprosessen favoriserer ett resultat fremfor et annet. For eksempel kan en studie som baserer seg på selvrapporterte data være partisk hvis deltakerne er mer sannsynlig å rapportere visse atferder eller symptomer enn andre.
Til slutt kan epidemiologiske studier være tidkrevende og kostbare å gjennomføre. Dette kan begrense antall studier som kan gjøres og gjøre det vanskelig å studere sjeldne sykdommer eller tilstander.