Ugler har en svært muskuløs proventriculus (en del av magen) som lagrer mat og letter triturering (maling) av inntatt materialer. Proventriculus er foret med et tykt lag med muskler som trekker seg sammen og slapper av for mekanisk å bryte ned maten til mindre partikler. De utskilte magesaftene starter kjemisk fordøyelse, og den mykede massen går videre gjennom fordøyelsessystemet.
Pellets
På grunn av ufordøyeligheten til visse komponenter som bein, pels, fjær og eksoskjeletter, blir de mykede materialene ofte oppblåst som pellets. Pellets er et særtrekk for ugler, ofte funnet i nærheten av deres raste- eller hekkeplasser. Disse pellets gir verdifull informasjon for biologer og forskere, da de kan avsløre uglens diett og gi innsikt i økosystemdynamikk.
Tynntarm
Etter oppstøt av pelleten beveger det gjenværende nedbrutte matmaterialet seg videre inn i tynntarmen. Her absorberes næringsstoffene fra det fordøyde byttet inn i blodet gjennom villi (små, fingerlignende fremspring) som langs tarmveggene. Enzymer som skilles ut av bukspyttkjertelen, leveren og tarmkjertlene bidrar ytterligere til næringsopptaket.
Tykktarm og Cloaca
Eventuelt ufordøyd materiale passerer gjennom tykktarmen hvor det opplever en endelig ekstraksjon av vann og elektrolytter før det til slutt blir utstøtt gjennom cloacaen (en enkelt åpning som fungerer som det felles utløpet for fordøyelses-, urin- og reproduksjonssystemene hos fugler). Det dehydrerte, faste avfallet fjernes som avføring.