Cupcakes er en type kake, og gjennomsnittlig fordøyelsestid for kake er ca 2-3 timer. Dette kan imidlertid variere avhengig av individet og andre faktorer som størrelsen på cupcaken, ingrediensene som brukes, og personens generelle helse og metabolisme. For eksempel vil en cupcake laget med hele korn og frukt ta lengre tid å fordøye enn en cupcake laget med raffinert mel og sukker. I tillegg kan personer med fordøyelsesproblemer eller langsom metabolisme ta lengre tid å fordøye cupcakes.