Et fagolysosom inneholder materiale som er fagocytert og er i ferd med å bli fordøyd. Et fagolysosom er en membranbundet organell som dannes ved fusjon av et fagosom og et lysosom. Fagosomet er en liten vesikkel som inneholder materiale som har blitt fagocytert, eller oppslukt, av en celle. Lysosomet er en liten vesikkel som inneholder fordøyelsesenzymer. Når et fagosom og et lysosom smelter sammen, frigjøres fordøyelsesenzymene i lysosomet til fagosomet, og materialet inne i fagosomet brytes ned til mindre molekyler.
