Leger dypper vanligvis ikke termometre i væske før bruk. Noen termometre, spesielt de som brukes til å måle kroppstemperatur, kan ha et sondedeksel eller et engangsprobedeksel som fjernes før bruk. Dette bidrar til å forhindre spredning av bakterier og infeksjoner. Leger kan også bruke desinfiserende kluter eller andre metoder for å rengjøre termometerets sonde før og etter hver bruk.