Parasympatiske nerver stammer fra vagusnerven (kranialnerven X) og bekkensplanchniske nerver. De har generelt en eksitatorisk effekt på fordøyelseskanalen, øker bevegelighet og sekret.
Sympatiske nerver stammer fra bryst- og lumbalområdet i ryggmargen. De har generelt en hemmende effekt på fordøyelseskanalen, reduserer bevegelighet og sekret.
Det enteriske nervesystemet er et nettverk av nerver som er plassert innenfor veggene i fordøyelseskanalen. Det kalles noen ganger "tarmens hjerne" fordi det uavhengig kan kontrollere mange av fordøyelsesfunksjonene, som bevegelighet og sekret.