Mens kokende vann kan drepe bakterier og mikroorganismer, kan det også forårsake skade på CPAP-maskinen og dens komponenter. Den høye temperaturen til kokt vann kan potensielt smelte eller deformere plastdeler, skade tetninger og pakninger, og til og med føre til at CPAP-maskinen ikke fungerer eller blir mindre effektiv.
I stedet for å bruke kokt vann, anbefales det å følge produsentens anvisninger for rengjøring og vedlikehold av CPAP-maskinen. Dette kan innebære bruk av destillert vann eller en CPAP-spesifikk rengjøringsløsning for å sikre riktig hygiene og forhindre skade på enheten.