Mekanisk fordøyelse setter i gang fordøyelsesprosessen ved fysisk å bryte ned maten til mindre partikler. Tyggevirkningen av tennene, skurrende sammentrekninger i magen og segmentering av tynntarmen bidrar alle til mekanisk fordøyelse. Når maten er mekanisk brutt ned, tar kjemisk fordøyelse over. Enzymer som skilles ut av spyttkjertlene, magen, bukspyttkjertelen og tynntarmen begynner å bryte ned de komplekse matmolekylene til enklere. Amylase bryter ned karbohydrater, protease bryter ned proteiner og lipase bryter ned fett. Disse enzymene bryter ned matmolekylene til mindre og mindre komponenter til de er små nok til å bli absorbert av kroppen.
