En annen årsak til menstruasjonshodepine er prostaglandiner. Prostaglandiner er hormonlignende stoffer som produseres av livmoren under menstruasjon. De kan føre til at musklene i livmoren trekker seg sammen, noe som kan føre til smerte og hodepine.
I tillegg kan noen kvinner oppleve hodepine på grunn av endringer i blodsukkernivået i løpet av mensen. Når østrogen- og progesteronnivået faller, kan blodsukkernivået også synke, noe som kan forårsake hodepine.
Til slutt kan noen kvinner oppleve hodepine på grunn av stress og angst knyttet til mensen. Stress og angst kan forverre symptomene på hodepine.