Parafinolje er brannfarlig og har et lavt flammepunkt (vanligvis rundt 200°C), så det anses generelt ikke som trygt å autoklavere. Parafinoljedamp kan også skape en eksplosiv atmosfære hvis den kommer i kontakt med en varmekilde. I tillegg kan parafinolje reagere med oksygen for å danne peroksider, som kan være støtfølsomme og potensielt eksplosive.
På grunn av dens brennbarhet og andre farlige egenskaper, anbefales ikke autoklavering av parafinolje og bør unngås. Alternative metoder for sterilisering eller desinfisering av materialer eller utstyr bør brukes i stedet.
