Jaguarer, som alle pattedyr, har mange muskler i hele kroppen som muliggjør bevegelse og ulike kroppsfunksjoner. Mens det nøyaktige antallet muskler i en jaguar kan variere basert på anatomiske klassifiseringsmetoder, antyder et generelt estimat at det er omtrent 639 skjelettmuskler i en jaguars kropp. Disse musklene er ansvarlige for en rekke bevegelser, inkludert gange, løping, klatring, jakt og sosial atferd som frieri og territorielle visninger.
