Her er en forenklet oversikt over den biologiske prosessen som ligger til grunn for døgnrytmen:
1. Klokkegener :Døgnklokken styres hovedsakelig av et sett med klokkegener, som koder for klokkeproteiner. Disse genene inkluderer kjerneklokkegenene som Clock, Bmal1, Per1, Per2, Cry1 og Cry2.
2. Tilbakemeldingsløkke for transkripsjon og oversettelse :Klokkegenene er involvert i en transkripsjonell-translasjonell tilbakemeldingssløyfe som regulerer deres eget uttrykk. Klokke- og Bmal1-proteiner dimeriserer og aktiverer transkripsjonen av Per- og Cry-gener. PER- og CRY-proteiner akkumuleres i cytoplasmaet og translokerer gradvis til kjernen. I kjernen hemmer de Clock-Bmal1-aktivitet, og undertrykker dermed sin egen transkripsjon. Denne negative tilbakekoblingssløyfen genererer en rytmisk oscillasjon av klokkegenuttrykk.
3. Endringer etter oversettelse :Post-translasjonelle modifikasjoner, som fosforylering og ubiquitinering, spiller en avgjørende rolle i reguleringen av klokkeproteinstabilitet, aktivitet og interaksjoner. Disse modifikasjonene finjusterer døgnklokkens rytme og respons på miljøsignaler.
4. Lysinngang og synkronisering :Døgnklokken er synkronisert med det ytre miljøet, spesielt lys-mørke-syklusen, gjennom den primære lysfølsomme strukturen hos pattedyr, netthinnen. Spesialiserte retinale ganglionceller som inneholder fotopigmenter (melanopsin) overfører lyssignaler til den suprachiasmatiske kjernen (SCN) i hypothalamus. SCN fungerer som den sentrale circadian pacemakeren og synkroniserer perifere klokker i hele kroppen.
5. Utgangsveier og fysiologisk regulering :Døgnklokken regulerer et bredt spekter av fysiologiske prosesser gjennom utgangsveier som involverer genuttrykk, hormonfrigjøring og nevral signalering. Den kontrollerer søvn- og våknesykluser, kroppstemperatursvingninger, metabolske funksjoner, hormonsekresjon og mange andre rytmiske prosesser.
6. Perifere klokker :I tillegg til den sentrale klokken i SCN, har de fleste perifere vev og organer sine egne døgnklokker. Disse perifere klokkene er synkronisert med den sentrale klokken, men kan også vise vevsspesifikke rytmer drevet av lokale signaler, inkludert temperaturendringer og tilgjengelighet av næringsstoffer.
Døgnklokken, med sine intrikate molekylære mekanismer og synkronisering til eksterne signaler, gjør det mulig for organismer å forutse og tilpasse seg daglige miljøendringer, optimalisere fysiologiske prosesser og opprettholde generell homeostase og velvære.