Mat som ikke blir fordøyd og absorbert passerer gjennom tykktarmen, også kjent som tykktarmen. I tykktarmen absorberes vann og elektrolytter fra det gjenværende matmaterialet, og bakterier fermenterer de ufordøyde karbohydratene, og produserer gasser som hydrogen, karbondioksid og metan. Det gjenværende avfallsmaterialet, sammen med disse gassene, danner avføring, som lagres i endetarmen til den blir eliminert gjennom avføring.