Bakterier:
* Firmicutes :Overveiende bakterier i tykktarmen, inkludert nyttige arter som *Lactobacillus*, *Ruminococcus* og *Clostridium*.
* Bacteroidetes :En annen hovedgruppe av bakterier involvert i nedbrytningen av komplekse karbohydrater og gjæringsprosesser.
* Proteobakterier :En mangfoldig gruppe inkludert noen potensielt patogene bakterier som *Escherichia coli*.
* Actinobacteria :En liten gruppe involvert i fibernedbrytning og produksjon av bioaktive forbindelser.
Arkea:
* Metanogener :Disse mikroorganismene produserer metangass som et biprodukt av deres metabolisme. De spiller en rolle i tarmens evne til å bryte ned visse komponenter i maten.
Virus:
* Bakteriofager :Virus som spesifikt infiserer og replikerer i bakterieceller. De påvirker bakteriepopulasjoner og har implikasjoner for å opprettholde mikrobiell balanse.
Sopp:
* Sopp :Nyttige gjærarter som *Saccharomyces cerevisiae* kan forekomme i små mengder. Candida-arter kan også finnes i tarmen, men kan bli problematiske hvis de gror over.
Protister:
* Protozoer :Encellede organismer som *Entamoeba* og *Giardia* kan være tilstede, noen fungerer som kommensaler mens andre kan forårsake tarminfeksjoner.
Det er verdt å merke seg at sammensetningen av tarmmikrobiota kan variere betydelig mellom individer på grunn av faktorer som kosthold, genetikk, miljøeksponering og medisinske tilstander. Å opprettholde en mangfoldig og balansert tarmmikrobiota er generelt forbundet med ulike helsemessige fordeler, inkludert fordøyelse, næringsopptak, immunsystemfunksjon og beskyttelse mot skadelige patogener. Forstyrrelser i denne balansen, kjent som dysbiose, har vært knyttet til flere sykdommer og tilstander.